藻琴湖(もことこ)は、北海道東部、網走市にある汽水湖。
海跡湖である。二級河川藻琴川が流入し、オホーツク海に流出する。冬は結氷する。 非改変湖沼区分は改変である。
アイヌ語が由来であるが諸説ある。
1958年(昭和33年)7月1日指定の網走国定公園に属しており、2016年(平成28年)環境省の生物多様性の観点から重要度の高い湿地(重要湿地)にも選定されている。 湖の東へ約1kmには濤沸湖があり、ラムサール条約に登録されているが、当湖は未指定であり、鳥獣保護区も未設定である。
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