黃其晟(?—17世紀),原名黄仲曄,字芝仲,號平墅,又號元眉,福建泉州府同安縣人,明朝、南明政治人物。
黃其晟是萬曆四十三年(1615年)乙卯科十三名舉人,天啟二年(1622年)成進士,户部观政,本年擔任內閣中書,七年任顺天同考,授广东道监察御史,崇祯元年(1628年)巡視東城,又巡青。二年巡视陕西茶马,三年出爲江西撫州府知府,四年丁忧归。十年起补南昌府知府,奉旨改名其晟。十六年补任桂林府知府,陞廣西南寧道副使,任內有德政。
永曆帝繼位,讓黃其晟陞任工部右侍郎;永曆二年(1648年)正月,他和蔡世承一同出任兵部左侍郎及右侍郎,但未赴官。之後他跟隨永曆帝到緬甸,被清朝軍隊抓拿入獄六年,回鄉後去世。
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