巴斯德研究院(法語:Institut Pasteur)總部位於巴黎,是法國的一個私立非營利研究中心,致力於生物學、微生物學、疾病和疫苗的相關研究。其創建者路易·巴斯德於1885年研發出第一劑狂犬病疫苗和第一剂炭疽病疫苗。
1887年6月4日,巴斯德研究院在法国巴黎成立。 1888年11月4日,於隔年獲國家認可而開始營運。
此後巴斯德研究院對於傳染病的防治研究一直處於領先地位,1983年成為第一個成功分離出人类免疫缺陷病毒(HIV)的機構,對於白喉、破傷風、結核、小兒麻痺、流行性感冒、黃熱病和鼠疫等疾病,也成就許多革命性的發現,自1908年起,共有10位科學家於此機構獲得諾貝爾生理醫學獎。其中的研究者包括:
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