Margarita de Habsburgo (Innsbruck, 16 de febrero de 1536 – Hall in Tirol, 12 de marzo de 1567). Archiduquesa de Austria y miembro de la Casa de Habsburgo, era hija del emperador Fernando I de Habsburgo y de Ana Jagellón de Hungría y Bohemia.
Con sus hermanas Magdalena y Elena fundó el convento para monjas de Hall, construcción empezada en 1567 y completada dos años después. Margarita nunca pudo ver el fin de la obra pues murió en ese año, con solo 31 años.
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